Город Копер лежит на побережье Словении в трех милях к югу от границы с Италией и в четырех милях к востоку от гавани Изола. Копер - единственный торговый порт в Словении, а также самая северная гавань на коротком побережье страны. В дополнение к очаровательному старому городу, в Копере есть небольшая яхтенная Марина Копер, предлагающая 75 причалов для яхт.
Копер связан современным шоссе со столицей страны Любляной, а также с итальянским Триестом и хорватской Истрией. Регулярное автобусное сообщение есть с Любляной, соседними городами Словении, Хорватии и Италии. В Копере имеется также железнодорожная станция, но по сравнению с автомобильным и морским транспортом железная дорога используется весьма слабо. Копер находится в 20 км от аэропорта Порторож и 128 км от аэропорта Любляна.