Остров Муртер расположен у материкового побережья Хорватии в 10 милях к западу-северо-западу от Шибеника и в 23 милях к юго-востоку от Задара. Муртер отделен от материка с северо-восточной стороны узким и мелким (минимальная глубина 2,4 метра) каналом у городе Тисно. В этом месте остров соединен с материком подъемным автомобильным мостом, поэтому яхты с осадкой чуть более двух метров и меньше могут проходить этим путем.
Несмотря на то, что Муртер является одним из небольших островов, он исключительно хорошо подходит для путешествия яхте. На нем есть три яхтенные марины, хорошо оборудованная верфь и несколько якорных стоянок с разных сторон острова. Все марины острова Муртер в той или иной степени предоставляют яхтам убежище от боры, лучшее в марине Джезера Муртер, которая защищена практически ото всех ветров.
Остров популярен летом как место ночной стоянки яхт путешествующих с материка на архипелаг Корнати. Главный город острова - Муртер Таун расположен в широкой бухте на северной стороне острова, защищенной от северных ветров цепочки небольших островов.