Несмотря на то, что Наксос самый большой остров Киклад, яхтенных стоянок у его побережья не так уж и много. Яхтенная марина всего одна - она находится в порту Наксос. Есть еще одно место, где яхты могут встать у пирса - это маленький рыбный порт Калантос. Остальные стоянки яхт у острова Наксос якорные. Это бухта Аполлона (Ormos Apollonos) на северо-востоке острова; бухта Moutsouna в середине восточного побережья; бухта Каландо (Ormos Kalando) и безымянная бухта чуть западнее мыса Panormos; бухты Prokopis и Kouroupa на западном побережье южнее Наксоса.