На Санторине есть одна яхтенная марина марина юге острова. Пожалуй это наиболее безопасное и защищенное место стоянки яхт на острове. На северо- западе острова можно встать на яхте у пирса в деревне Ия. Кроме того имеется несколько якорных стоянок для яхт как на самом Санторине, так и и на островках внутри подковы - Тирасии, Палеа-Камени, Неа-Камени.