Остров Эгина имел важное значение в древности. Это была мощная морская и торговая держава, здесь чеканили первые греческие монеты, добывали лучшую медь, изготовляли керамические изделия.
Расцвет острова пришёлся на VII-V вв до нашей эры, торговцы острова контролировали торговлю с Египтом. «Эгинский талант» был принят стандартной мерой для драгоценных металлов.
В это время был построен храм Афайи, хорошо сохранившийся до наших дней, обладающий совершенными пропорциями. Храм являлся одним из первых памятников классической эпохи (V в. до н.э). Фронтоны храма Афайи были богато украшены скульптурой, изображающие сюжеты троянской войны, войны греков, героев и богов.
По преданию, Афайя была критской богиней. На острове Эгина она нашла убежище, убегая от преследований Миноса, царя Крита. В том месте, где построен храм, Афайя вспорхнула в небо и стала невидимой, так переводится её имя. Внутри храма возвышалась целла со скульптурой богини Афайи. Недалеко от храма находился бассейн с оливковым маслом, где древние греки совершали жертвоприношения.
Остров Эгина всегда соперничал и враждовал с Афинами, причиной тому было торговое соперничество. Остров был на стороне Спарты, главного врага Афин. В 456 г. до н.э. афиняне захватили остров и сделали его своей колонией.
Во времена Александра Македонского, Эгина перешёл в руки македонцев.
В византийский период, Эгина был частью Эллады.
В 1718 году Эгина был зыхвачен турками.
После освободительной войны от турецкого владычества, на остров Эгина переселилось правительство молодой Греческой республики.
В 1828 году остров становится неофициальной столицей Греции во главе с И. Каподистрия.
Монета, с изображением символа освобождения птицы Феникса и первая типография, выпускавшая газеты свободной Греции - придавали острову огромную значимость.